Points clés
- Les antibiotiques peuvent décimer les microbes intestinaux d’une personne.
- Un microbiote altéré peut affecter l’humeur et la cognition.
- Il pourrait bientôt être possible d’atténuer les effets néfastes des antibiotiques sur l’intestin.
« Grâce aux vaccins et aux antibiotiques, de nombreuses maladies infectieuses appartiennent désormais au passé. Nous en sommes venus à penser que la santé publique et la science moderne pouvaient venir à bout de tous les microbes. Mais la nature est un adversaire redoutable. – Tom Frieden
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Les antibiotiques constituent un véritable miracle médical. Lorsqu’il s’agit d’infections bactériennes, rien n’est comparable. Les antibiotiques ont sauvé des millions de vies. Une coupure ? Des antibiotiques. Une angine à streptocoques ? Des antibiotiques. Un rhume ? Des antibiotiques. J’ai ajouté ce dernier point pour voir si vous étiez attentif. Les rhumes sont causés par des virus, pas par des bactéries, et les antibiotiques ne sont d’aucune utilité, même minime. Et alors ? Mieux vaut prévenir que guérir, n’est-ce pas ?
Le mauvais
Cependant, les antibiotiques ont un côté sombre, et vous devez en être conscient. Les scientifiques savent depuis longtemps qu’il existe un lien direct entre la psychose aiguë et certains antibiotiques, notamment la pénicilline, les fluoroquinolones, les céphalosporines et les macrolides.
Cet aspect s’avère difficile à mesurer : les antibiotiques sont administrés en raison d’une infection ou d’une inflammation, qui peut elle-même entraîner une psychose. Toutefois, le lien de causalité a été établi dans des cas où la psychose a disparu à l’arrêt des antibiotiques et est réapparue à la reprise des antibiotiques.
Il ne s’agit pas d’une nouvelle découverte ; les médecins ont documenté une grande variété de complications mentales liées à la pénicilline depuis 1945. La liste des symptômes est longue : crises d’épilepsie, aphasie, spasmes, psychose, confusion, léthargie, anxiété et coma.
Comment
Il n’y a pas que la pénicilline : Les effets secondaires psychiatriques documentés des antibiotiques autres que la pénicilline vont de symptômes bénins à des délires et psychoses graves. Quel est ce lien mystérieux entre les antibiotiques et le cerveau ? Le principal suspect est le microbiote intestinal, l’ensemble des microbes qui vivent dans notre intestin et nous aident à digérer et à nous défendre contre les agents pathogènes.
Les antibiotiques oraux peuvent gravement endommager le microbiote. Après tout, c’est là tout l’intérêt des antibiotiques : tuer les bactéries. Des études ont montré que votre microbiote peut affecter votre cerveau par l’intermédiaire de l’axe intestin-cerveau. Les antibiotiques peuvent tuer les bactéries qui produisent des neurotransmetteurs comme le GABA, la dopamine et la sérotonine, ce qui peut affecter votre cognition et votre humeur. La bonne nouvelle, c’est qu’à l’arrêt des antibiotiques, les problèmes mentaux disparaissent généralement rapidement.
Les perturbations du microbiote peuvent avoir un impact particulier sur les enfants. Les 1 000 premiers jours de notre enfance sont particuliers. C’est à ce moment-là que notre système immunitaire doit apprendre à tolérer nos bactéries bénéfiques. Bien que les détails soient encore obscurs, le travail doit être fait, sinon nous serons toujours en train de combattre nos microbes utiles, ce qui nous expose à une inflammation à long terme.
Un bon microbiote n’est pas seulement important pour nos intestins : Un microbiote adéquat contribue également au développement normal du cerveau. L’administration d’antibiotiques pendant cette période d’adaptation risque de tuer les bactéries dont nous avons besoin. Chez les souris, un manque de bactéries peut provoquer une réaction anormale au stress. Fournir à ces souris un microbiote sain les remet sur la bonne voie, mais seulement si elles sont âgées de moins de trois semaines. Passé ce délai, leur réaction au stress ne peut plus se rétablir.
Les humains ne sont pas des souris, mais les nourrissons qui prennent des antibiotiques ont un microbiote moins diversifié et sont plus susceptibles de souffrir de MICI et de dépression à l’âge adulte. Si votre enfant en a vraiment besoin, n’hésitez pas, mais gardez à l’esprit qu’il peut y avoir des conséquences à long terme.
Le bon
En 1882, Robert Koch a découvert que la tuberculose était causée par une bactérie, et des sanatoriums ont rapidement été créés pour s’occuper des patients contagieux. Les personnes atteintes de tuberculose sont souvent déprimées et les sanatoriums sont généralement des lieux calmes et sombres.
En 1951, des chercheurs ont décidé de tester un nouvel antibiotique, l’isoniazide, pour traiter les bactéries de la tuberculose. À leur grande surprise, les patients ont réagi bizarrement : ils se sont mis à rire et à danser dans les couloirs. Le personnel s’est mis à faire taire ses patients normalement réservés. Les chercheurs ont réalisé que, par pur hasard, ils avaient découvert le premier antidépresseur.
Ils ont découvert que l’isoniazide empêchait la dégradation des neurotransmetteurs, notamment la sérotonine, la dopamine et l’épinéphrine. La course était lancée pour trouver de nouveaux médicaments capables d’agir sur les neurotransmetteurs. C’est ainsi que sont nés tous les antidépresseurs modernes, comme le Prozac, le Wellbutrin, le Zoloft et d’autres encore.
Pratiquement oublié dans tout ce battage médiatique : l’isoniazide est un antibiotique. En plus d’améliorer l’humeur, ce médicament modifie le microbiote. Il s’agissait d’un premier aperçu du lien entre les microbes et les fonctions cérébrales, mais il a été rapidement oublié.
L’encéphalopathie hépatique, un problème de foie qui affecte le cerveau, est un autre facteur de succès pour les antibiotiques et l’humeur. Elle peut provoquer de l’anxiété et de profonds changements de personnalité. Ce n’est pas nouveau : Hippocrate a noté que les patients souffrant d’une maladie du foie étaient de mauvaise humeur. Il a déclaré : « Ceux qui sont fous à cause de la bile sont véhéments, vicieux et ne se taisent pas ».
Le coupable est l’ammoniaque, qui provoque un œdème dans le cerveau. S’il n’est pas traité, il peut conduire au coma et à la mort. L’ammoniaque est un produit de certaines bactéries intestinales. Un traitement est le lactulose, un sucre consommé par les bactéries lactobacilles, qui se multiplient et produisent de l’acide lactique. L’augmentation de l’acidité tue un grand nombre de ces producteurs d’ammoniac.
Un autre traitement est la rifaximine, un antibiotique qui agit directement sur les bactéries intestinales. La possibilité de traiter cette psychose particulière à l’aide d’antibiotiques nous rappelle une fois de plus l’impact inattendu de nos bactéries intestinales sur notre cerveau.
La confusion
Dans les pays du tiers-monde où les infections sont endémiques, la prise d’antibiotiques pendant la grossesse peut augmenter les chances que le bébé ait un poids sain à la naissance. Mais dans les pays à revenu élevé, l’utilisation d’antibiotiques pendant la grossesse est associée à un faible poids à la naissance. Comment cela se fait-il ?
La plupart des mères ne le savent pas, mais elles transmettent à leurs enfants bien plus que leurs propres gènes: Elles transmettent également des gènes microbiens. Ainsi, lorsque la mère tombe malade ou prend des antibiotiques, cet héritage microbien peut être affecté. Les infections maternelles et l’utilisation d’antibiotiques pendant la grossesse sont associées à des taux accrus de schizophrénie, d’autisme, d’anxiété et de dépression plus tard dans la vie de l’enfant.
Avant de désespérer, rappelez-vous que les associations n’impliquent pas la causalité, et que les antibiotiques pendant la grossesse peuvent sauver la vie de la mère et du bébé. Il convient toutefois de garder à l’esprit que les antibiotiques à large spectre peuvent également endommager le microbiote d’une manière qui pourrait avoir un effet durable sur l’enfant.
L’essentiel
Les antibiotiques dégradent certaines espèces bactériennes, ce qui permet à d’autres de venir grossir les rangs. Dans un microbiote équilibré, ces nouvelles recrues sont de bons voisins. Mais lorsqu’on les laisse proliférer, elles peuvent provoquer une dysbiose. Lorsque vous prenez des antibiotiques, vous ne voulez pas encourager leur prolifération. Vous ne voulez peut-être pas que les fibres prébiotiques amplifient les survivants incertains d’une bataille d’antibiotiques. Il vaut mieux manger des aliments simples comme le riz et les bananes jusqu’à ce que le traitement antibiotique soit terminé.
Lorsque vous arrêtez de prendre des antibiotiques, vous devez rétablir votre bon vieux voisinage de microbes. Le mieux est de manger une grande diversité d’aliments contenant beaucoup de polyphénols colorés et différents types de fibres. Un mélange de prébiotiques peut être un complément utile si vous ne pouvez pas consommer suffisamment de légumes diversifiés. Un régime de type méditerranéen est un excellent moyen de se remettre d’un traitement antibiotique. Il est également délicieux.
L’alcool peut exacerber les problèmes d’étanchéité de l’intestin, il faut donc l’utiliser avec modération. Les sodas, les bonbons et autres sucreries nourrissent les champignons. Les bactéries et les champignons entretiennent une relation complexe, mais lorsque les antibiotiques éliminent les bactéries, les champignons profitent d’une résurgence en raison de la diminution de la concurrence. La prolifération des champignons peut être difficile à contrôler, il ne faut donc pas l’encourager.
L’avenir
Une étude allemande menée par Lisa Maier, Camille Goemans et des collègues du Laboratoire européen de biologie moléculaire permet d’espérer de meilleurs résultats en matière d’antibiotiques. Les chercheurs ont examiné 144 antibiotiques différents et ont surveillé la façon dont ils affectaient des bactéries intestinales spécifiques. Ils ont découvert que plusieurs médicaments inattendus pouvaient protéger le microbiote intestinal contre les dommages causés par les antibiotiques. Il s’agit notamment du dicumarol (un anticoagulant), du benzbromarone (un médicament contre la goutte), de l’acide tolfénamique et du diflunisal (des anti-inflammatoires).
Ces médicaments permettent aux antibiotiques d’attaquer leurs cibles sans tuer les bactéries bénéfiques. Selon M. Maier, cette nouvelle approche, qui associe les antibiotiques à des médicaments protecteurs, pourrait réduire les effets secondaires nocifs des antibiotiques, notamment la psychose. Il faudra toutefois du temps pour qu’elle devienne un protocole standard.
Les antibiotiques sont des médicaments extraordinaires qui ont sauvé des millions de vies, mais dans la nature, rien n’est blanc ou noir. Les histoires racontées ici montrent que le lien entre l’intestin et le cerveau est vulnérable aux antibiotiques. C’est un facteur important à prendre en compte la prochaine fois que vous aurez une infection.
Références
Maier, Lisa, Camille V. Goemans, Jakob Wirbel, Michael Kuhn, Claudia Eberl, Mihaela Pruteanu, Patrick Müller, et al. « Unravelling the Collateral Damage of Antibiotics on Gut Bacteria ». Nature 599, no. 7883 (novembre 2021) : 120-24.
Essali, Norah, et Brian J. Miller. « Psychose comme effet indésirable des antibiotiques ». Brain, Behavior, & Immunity – Health 9 (décembre 2020) : 100148.
Mostafa, Safinaz, et Brian J. Miller. « Psychose associée aux antibiotiques pendant le traitement des infections urinaires : A Systematic Review ». Journal of Clinical Psychopharmacology 34, no. 4 (août 2014) : 483.
Yousafzai, Zaland A, Qazi Kamran Amin, Wajeeha Qayyum, Azhar Saeed, et Nouman Anthony. « Délire aigu induit par la ciprofloxacine chez une jeune femme ». Cureus 14, no. 5 (n.d.) : e25182.

